牛道明表示，「當時找不到空間、到處去借，而且大部分醫師來協助是一毛錢都沒有的，要感謝臺北榮總有這群熱心的醫師，願意花時間來共同建立聯合門診。」最初，所有參與的醫師就擠在一個小診間裡、共用一台電腦，到現在變成比較寬敞的診間，有投影設備可以一起討論。目前的聯合門診更結合營養師、心理師、遺傳諮詢師及社工師，提供病人與家屬完整的諮詢與照護。
追求卓越 寫下多個醫療界的「第一」
牛道明於2011年成立亞洲第一個「罕見疾病研究治療中心」，提供以病人為中心的安全優質醫療環境，不僅有罕病患者專屬治療病床，更針對罕見疾病患者開放夜間、假日治療服務，讓病人可以兼顧生活與治療，目前每年於罕見疾病治療中心進行治療之病患約有4,000多人次。
有了完整的研究治療中心，牛道明更與團隊努力研究藥物型苯酮尿症病童的治療，讓接受治療的病童平均智商高達97分，大幅領先國內外其他醫療團隊平均為70多分的水準，治療成效世界第一，這項研究成果已刊登於美國神經醫學一流期刊（Archives of Neurology），並於國際醫療間獲得極高的評價，優異的治療成效創下驚人的世界紀錄。
牛道明也與其團隊建立起高效率的嬰兒型龐貝氏症確診方法。他說，在臺北榮總一名新生兒只要篩檢出現龐貝氏症陽性，只需6個小時就可以得到正確診斷及治療，讓病童的平均治療時間提早到出生10天之內，較國際間醫療中心需要22天才能開始治療的時間更為提早，病童的癒後情形也有極大的差距。
另外，牛道明的團隊也率先發現臺灣法布瑞氏症發生率世界第一，其研究發現臺灣好發的法布瑞氏症突變點位，會導致成年人的心臟肥大及病變，將此疾病視為臺灣一項重要的健康議題；之後團隊所發表的多項法布瑞氏症重要研究，除獲得國內外專家學者的肯定外，甚至顛覆全世界對於心臟型法布瑞氏症的認知，改寫目前世界上的治療準則。在臨床及學術上卓越的成就，讓牛道明團隊於2020年以「獨步全球－法布瑞氏症研究治療中心」獲頒SNQ國家品質標章金獎的殊榮。
結合精準與智慧醫療 推動全基因檢測
牛道明致力於推廣臺灣新生兒篩檢，近年更推動全基因定序檢測。他解釋，臺北榮總現在不只是把基因定序出來，最重要的是建立了一套非常好的全基因自動分析系統，可以在極短時間內分析出結果，除了找出隱藏的疾病之外，還可分析體質對哪些藥物會產生嚴重副作用，「如果可以及早知道，除了能避免嚴重副作用的產生，還能精準用藥，達到最好的治療效果」。
與基因相關的發展與應用越來越多元，牛道明指出，這一套全基因自動分析系統未來還會套用人工智慧（AI），結合精準醫療與智慧醫療，藉由人工智慧學習、不斷地自動更新，運用新資訊進行基因的再分析，讓每個人對自己的基因更加了解，未來醫師診察、治療時都能有效參考運用，充分達到個人化的精準醫療。
