10/03-04
本部舉辦「推動新南向傳統醫學人員交流會」，與馬來西亞及越南分享我國中醫臨床照護、中藥材與中藥製劑品質管理、中藥用藥安全及中醫治療COVID-19等經驗，計140人次參加。
10/05
公告修正「連鎖飲料便利商店及速食業之現場調製飲料標示規定」，增修訂「添加糖量及該糖量所含熱量之標示」、「總咖啡因含量標示方式」、「果蔬汁含量未達10％者之品名標示」規定，自110年1月1日起實施。
10/05
本部疾病管制署舉辦「守護我們所愛的人」公費流感疫苗開打記者會，陳部長時中、周署長志浩及莊副署長人祥共同出席，並於現場與防疫大使潘若迪及雙胞胎幼兒、孕婦等公費對象一同進行接種，呼籲符合公費接種資格之民眾，儘速完成流感疫苗接種，守護自己及家人健康。
10/06
發布訂定「食品中微生物衛生標準」，整合「一般食品衛生標準」第5條有關微生物之規定及「乳品類衛生標準」等10項衛生標準之內容，自110年7月1日起施行，並將於實施前同時廢止「乳品類衛生標準」等10項標準。
10/06
本部社會及家庭署辦理「臺灣女孩日」宣導活動，由李政務次長麗芬攜手小紅帽（月經權益倡議組織）發起人林薇Vivi於女孩日前夕直播「女孩談心室」，分享「臺灣女孩日」的由來及精神，並呼籲各界重視女孩權益。
10/07
中央流行疫情指揮中心基於人道考量，針對居家隔離/檢疫者，因親屬身故或重病等社會緊急需求，需申請外出奔喪或探視之規定，調整為自居家隔離/檢疫第1天(含)起，無症狀者可向地方衛生單位提出申請。
10/12-17
本部國民健康署參與世界公共衛生學會聯盟召開之「第16屆世界公共衛生大會」，發表科技研究及業務計畫成果，並設置線上虛擬攤位，展示健康促進業務推動及重要衛生教育宣導素材，提升我國公共衛生成果之國際能見度。
10/13
本部舉辦「2020新南向傳統醫藥管理法規交流研討會」，邀請泰國、馬來西亞官方，採視訊方式專題報告最新傳統藥品管理法規及註冊規定，並分享臺灣中醫治療COVID-19等疾病之經驗，計70人現場及線上參與。
10/14
中央流行疫情指揮中心表示，由於口罩產能已充足可供應實名制通路銷售所需，再加上進口口罩管理措施已建立且已有執行成效，原先雙鋼印口罩之全面徵用提前於10月15日起恢復為定額徵用，以利國內口罩產能能透過自由市場滿足民眾需求，未來並將檢討實名制運作模式，俾及時因應防疫需求。
10/15-16
「第八屆臺日醫藥交流會議」，受限於COVID-19疫情因素，本次會議首度以現場視訊方式與日方連線辦理。臺日雙方代表分享藥物法規進展及因應COVID-19醫藥及醫療器材管理所面臨之挑戰，以及醫療器材品質管理系統(QMS)在「臺日醫療器材品質管理系統合作備忘錄」下之運用等，促進雙方法規資訊之交流及瞭解，強化雙邊官方及業者之合作。
10/16
公告109年10、11、12月份全民健康保險臺灣地區外自墊醫療費用核退上限。
10/16
本部社會及家庭署舉辦第1屆「永續in Power社會創新大賞」圓滿落幕，共計20個創新計畫得獎，李政務次長麗芬出席頒獎並表示，本活動三大創新特色，一是提案主題聚焦在聯合國永續發展目標（SDGs）；二是先培力、後競賽的機制；三是創造更多企業參與。
10/18
本部舉辦「臺灣－馬來西亞中醫臨床醫療交流會」，就當地常見疾病如：過敏、中風、慢性腎臟病、皮膚病及不孕症等，分享我國中醫臨床治療及用藥經驗，計45人現場及線上參與。
10/18
本部補助中華牙醫學會與金屬工業研究發展中心，透過視訊會議，與英國全球兒童口腔基金會、瑞士世界公共衛生協會聯盟、馬來西亞吉隆坡國際牙科中心、泰國植體醫學會等四個國家，簽署合作備忘錄，拓展臺灣口腔醫療技術與產業發展之國際能見度，陳部長時中出席見證簽署儀式並致詞勉勵。
10/19
為表達對百歲人瑞的關懷與尊敬，蔡總統英文在本部李政務次長麗芬陪同下，於重陽節前夕前往嘉義縣拜訪107歲人瑞黃德成先生、100歲人瑞呂陳娘女士，並親自致贈金鎖片、敬老狀等賀禮，祝福2位老人家身體健康、福壽延年，現場氣氛熱鬧、溫馨。
10/21
駐台北土耳其貿易辦事處代表Muhammed Berdibek與羅代表秘書美治一行2人拜會本部陳部長時中，就防疫物資與疫苗等議題進行意見交流，由食品藥物管理署、疾病管制署、國家衛生研究院與國際合作組陪同出席。
10/21
本部李政務次長麗芬及桃園市鄭市長文燦，前往拜訪105歲人瑞魏震木先生，代表總統致贈金鎖片及水果等賀禮，並為魏老先生暖壽，共同祝賀魏老先生重陽節快樂、健康、平安。
10/23
發布修正「直轄市、縣(市)政府辦理長期照顧特約及費用支付作業要點」部分規定，並自即日生效。
10/23-24
本部國際合作組、國民健康署及外交部舉辦「2020臺灣全球健康論壇」，主題為「在後疫情時代以創新、包容和夥伴關係實現永續發展目標」，採實體及線上並行方式舉行，蔡總統英文及陳部長時中蒞臨會場致開幕詞，約600人參加實體會議，共計來自60國約400人線上參加。
10/24
本部陳部長時中出席「翻轉吧！我的七老八十」重陽節慶祝活動，翻轉一般社會大眾對於老年的刻板印象，並藉此鼓勵長輩嘗試新事物，也提供年輕世代對於老年生活的理解及想像。
10/27
「健保25週年-健保資料人工智慧應用研討會」由15家申請團隊分享研究成果，賴副總統清德、國發會高副主任委員仙桂、科技部謝政務次長達斌及廣達電腦林董事長百里等蒞臨致詞，共計220名來自產、官、學、醫、研各界代表及30餘家媒體參加。
10/29
發布修正「全民健康保險醫療服務給付項目及支付標準」：新增乳房檢查項目1項及增列「達文西機械手臂部分腎切除」、調升精神復健(日間型機構)支付點數1項、增修支付規範2項及「達文西根治性前列腺切除術」、配合17項診療項目開放至基層院所，修正4項支付規範及論病例計酬附表支付編號，並自109年12月1日生效。
