9/1
為加強篩檢保障長者健康，指揮中心免費提供65歲以上長者5劑家用抗原快篩試劑，此免費領取份數，不計入實名制的購買資格。
9/1
為因應猴痘防治需求，本部疾病管制署向丹麥生技公司「巴伐利亞北歐」(Bavarian Nordic)採購之560劑猴痘疫苗JYNNEOS®抵臺。
9/2
公告修正「長期照顧服務人員訓練認證繼續教育及登錄辦法」。
9/2
財團法人臺灣醫療健康產業卓越聯盟基金會(MET)與日本Medical Excellence Japan(MEJ)拜會本部，由本部薛部長瑞元及石常務次長崇良接見，雙方就數位醫療、再生醫療、長照、藥事查驗等議題進行交流。
9/3
財團法人臺灣醫療健康產業卓越聯盟基金會(MET)與日本Medical Excellence Japan(MEJ)舉辦「推動臺日兩國醫療健康領域合作備忘錄簽約儀式暨臺日國際醫療交流研討會」，本部薛部長瑞元蒞臨致詞，石常務次長崇良出席擔任講座講者，以共同推動臺日兩國醫療健康領域合作。
9/4
本部辦理「世界自殺防治日」記者會，由薛部長瑞元主持，配合本年度世界自殺防治日主題「展現行動 創造希望」，併聚焦於「打造疫後健康心」，呼籲社會大眾關懷周遭親友心理健康，發揮「一問二應三轉介」的守門人精神，並頒發自殺防治媒體優質報導獎。
9/6
發布修正「護理機構分類設置標準」第三條附表二。
9/6
指揮中心宣布第一批1,728劑COVID-19預防用Evusheld單株抗體抵臺，提供無法接種疫苗或免疫功能低下的族群施打，以降低其染疫風險。
9/12、13、26
行政院林政務委員萬億率同本部、法務部、內政部、教育部、勞動部及原住民族委員會等部會，於花蓮縣、高雄市、臺北市辦理強化社會安全網第二期計畫地方政府外聘督導共識會議，凝聚各界共識，綿密社會安全網絡。
9/12
指揮中心宣布恢復美、加、紐、澳、歐洲與邦交國免簽證來臺待遇，入境人數總量上限仍維持每周5萬人。
9/12
本部食品藥物管理署舉辦「藥品實施GMP40週年暨PIC/S入會10週年論壇」，邀請賴副總統清德親臨勉勵及頒獎表揚推動GMP有功人士，期促進產官醫學研合作並共同努力，持續推動臺灣製藥產業邁向國際化。
9/13
公告訂定乳品加工食品業應實施食品安全管制系統準則之規定及廢止原公告，並自112年1月1日生效。
9/14
英國在臺辦事處鄧元翰代表(John Dennis)拜會本部薛部長瑞元，雙方就我國防疫政策、邊境管制措施、COVID-19治療用藥、臺英健康會談及醫衛合作交流等議題進行交流。
9/16
今年第一批採購Moderna次世代雙價疫苗80.4萬劑抵臺，並於9月24日起配送各縣市政府提供65歲以上長者、長照機構住民及18歲以上免疫不全及免疫力低下者追加劑接種使用。
9/17
為加強推展「零暴力･零容忍」社區意識，本部舉行111年「街坊出招8－社區防暴創意競賽」全國總決賽，本部李政務次長麗芬親自蒞臨，感謝社區夥伴對防暴工作的堅持，期待社區組織擔任防暴守門人，協助政府擴大服務觸角，落實暴力零容忍。
9/20
發布修正「身心障礙者鑑定作業辦法」第4條、第8條條文，自112年1月1日施行。
9/20
捷克參議院教科文委員會主席德拉霍斯(Jiří Drahoš)率團拜會本部薛部長瑞元，雙方就支持我參與WHO/WHA、臺捷防疫政策交流合作、臺捷健康衛生合作包括推動醫衛合作瞭解備忘錄等議題進行交流。
9/21-22
本部中央健康保險署舉辦「APEC數位健康照護與創新研討會」，本部由石常務次長崇良、李署長伯璋代表致詞，本部薛部長瑞元出席首日晚宴並致詞。會中官方代表及專家學者講述健康照護數位應用及未來發展。
9/23
發布修正「全民健康保險保險費及滯納金欠費催收暨轉銷呆帳作業要點」第五點、第十點。
9/24
本部辦理第8屆紫絲帶獎頒獎典禮，由薛部長瑞元親自頒獎表彰國內推動保護服務工作之傑出人士，另特別對於性侵害犯罪防治法、家庭暴力防治法、性騷擾防治法起草人及重要推手－已故前監察委員高鳳仙法官授予紫絲帶終身成就獎，為其一生對家庭暴力、性別暴力防治的投入與貢獻，表達最高敬意與懷念，活動當天亦選出防暴大使。
9/26
因應COVID-19 Omicron BA.4、BA.5等變異株，指揮中心自9月26日起免費提供全國55至64歲原住民約7萬人每人5劑COVID-19家用抗原快篩試劑。
9/26-27
本部國民健康署舉辦「111年衛生所人員基礎公共衛生核心能力教育訓練」，以「公衛心、傳承情、護健康」為主題，邀請薛部長瑞元為開訓記者會錄影致詞，考試院王委員秀紅分享公衛實務經驗，為社區健康服務在地化推進新的里程碑。
9/29
指揮中心宣布調增入境總人數為每週6萬人次，入境檢疫措施維持3天居家檢疫及4天自主防疫，前3天居家檢疫處所調整為「1人1室」，及配合邊境取消唾液採檢，調增入境旅客家用快篩試劑檢測措施。
9/29
公告修訂「111年全民健康保險牙醫門診總額特殊醫療服務計畫」，部分項目自111年10月1日生效。
9/29
本部辦理「2022年世界心臟日：緊急醫療救護智能平臺-護心行動」，由石常務次長崇良代表出席，活動藉由醫院分享到院前心跳停止（OHCA）個案實例，瞭解平臺的實際效用，並說明如何透過平臺醫療資訊的串接與加值應用，提升醫療照護品質。
